Beberapa fasilitas checkin seperti web checkin, smartphone application untuk checkin, dan city checkin adalah kemudahan yang diberikan maskapai penerbangan kepada para penumpang. Fasilitas checkin dapat dilakukan sendiri (self service) beberapa jam sebelum penerbangan.
Bagi para penumpang yang membawa bagasi, MCOJAYA sedang mengembangkan Self Service Bagdrop. Self Service Bagdrop terdiri dari Self Service Kiosk, timbangan, dan conveyor. Terletak di daerah konter checkin, sehingga memudahkan penumpang melayani diri sendiri.
Bagi penumpang yang sudah checkin melalui web, smartphone, city checkin, dapat menscan boarding pass, memasukkan jumlah bagasi dan mencetak label bagasi, menempelkan pada bagasi. Bagasi diletakkan pada timbangan, ditimbang oleh Self